Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Zbed3Q9D0L1 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms