Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Vmn1r216-203ENSMUST00000228389 10213 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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