Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm25709-201ENSMUST00000178844 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm24182-201ENSMUST00000179419 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm25064-201ENSMUST00000179535 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm26295-201ENSMUST00000179690 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Gm22823-201ENSMUST00000179754 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Gm24978-201ENSMUST00000179782 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm24967-201ENSMUST00000179791 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm22288-201ENSMUST00000179904 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm23512-201ENSMUST00000180237 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Gm26058-201ENSMUST00000180294 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm22418-201ENSMUST00000180326 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Gm24693-201ENSMUST00000083885 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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