Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Shroom4Q1W617 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Shroom4Q1W617 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Shroom4Q1W617 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Shroom4Q1W617 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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Shroom4Q1W617 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Shroom4Q1W617 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Shroom4Q1W617 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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Shroom4Q1W617 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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Shroom4Q1W617 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Shroom4Q1W617 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Shroom4Q1W617 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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Shroom4Q1W617 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Shroom4Q1W617 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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Shroom4Q1W617 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Shroom4Q1W617 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Shroom4Q1W617 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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Shroom4Q1W617 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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Shroom4Q1W617 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
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Shroom4Q1W617 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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Shroom4Q1W617 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Shroom4Q1W617 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Shroom4Q1W617 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Shroom4Q1W617 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Shroom4Q1W617 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Shroom4Q1W617 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Shroom4Q1W617 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Shroom4Q1W617 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Shroom4Q1W617 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Shroom4Q1W617 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Shroom4Q1W617 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Shroom4Q1W617 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Shroom4Q1W617 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Shroom4Q1W617 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Shroom4Q1W617 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Shroom4Q1W617 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Shroom4Q1W617 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Shroom4Q1W617 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Shroom4Q1W617 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Shroom4Q1W617 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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