Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Scgb2b28-ps-201ENSMUST00000188974 337 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC138401.2-201ENSMUST00000220461 365 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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