Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm29186-201ENSMUST00000189178 660 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm5358-201ENSMUST00000212814 353 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 CT010444.1-201ENSMUST00000219963 3845 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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