Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm25581-201ENSMUST00000083410 164 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Vmn1r46-202ENSMUST00000205088 10770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PtprmP28828 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PtprmP28828 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PtprmP28828 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PtprmP28828 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PtprmP28828 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PtprmP28828 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Zfp518a-201ENSMUST00000050092 6840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm24930-201ENSMUST00000158315 83 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PtprmP28828 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PtprmP28828 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PtprmP28828 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Olfr1309-206ENSMUST00000217452 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PtprmP28828 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms