Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a2P08122 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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