Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Dnah12-201ENSMUST00000022433 12009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 AC154462.1-201ENSMUST00000228897 2260 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tmem200cJ3QK46 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms