Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Vmn2r32-201ENSMUST00000094866 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Grik3B1AS29 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm27535-201ENSMUST00000183814 157 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm24544-201ENSMUST00000103862 110 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms