Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Limd1Q9QXD8 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Limd1Q9QXD8 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Limd1Q9QXD8 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Limd1Q9QXD8 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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