Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm23671-201ENSMUST00000157472 103 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm25727-201ENSMUST00000104522 131 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms