Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NischQ80TM9 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NischQ80TM9 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NischQ80TM9 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NischQ80TM9 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NischQ80TM9 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NischQ80TM9 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NischQ80TM9 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NischQ80TM9 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NischQ80TM9 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NischQ80TM9 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NischQ80TM9 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms