Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm43958-201ENSMUST00000204360 3544 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms