Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Olfr873-205ENSMUST00000215540 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cep290Q6A078 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms