Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms