Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Vmn2r32-201ENSMUST00000094866 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Vmn1r77-203ENSMUST00000227320 8308 ntAPPRIS P2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm24318-201ENSMUST00000104490 131 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
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