Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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Sh3bp2Q06649 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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Sh3bp2Q06649 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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Sh3bp2Q06649 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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Sh3bp2Q06649 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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Sh3bp2Q06649 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms