Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 2410024N13Rik-201ENSMUST00000090704 669 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Agtr2-201ENSMUST00000089188 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Vmn2r59-201ENSMUST00000168489 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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