Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 4930533N22Rik-201ENSMUST00000206433 3509 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms