Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PtprmP28828 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PtprmP28828 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PtprmP28828 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PtprmP28828 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Olfr665-202ENSMUST00000215761 2522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PtprmP28828 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PtprmP28828 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Vmn1r71-208ENSMUST00000228374 3717 ntAPPRIS P2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PtprmP28828 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PtprmP28828 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms