Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FxnO35943 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FxnO35943 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FxnO35943 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FxnO35943 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FxnO35943 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FxnO35943 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FxnO35943 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FxnO35943 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FxnO35943 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FxnO35943 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FxnO35943 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FxnO35943 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FxnO35943 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FxnO35943 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
FxnO35943 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
FxnO35943 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
FxnO35943 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
FxnO35943 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FxnO35943 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FxnO35943 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FxnO35943 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FxnO35943 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FxnO35943 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FxnO35943 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms