Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms