Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm26992S4R1A3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm26992S4R1A3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm26992S4R1A3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm26992S4R1A3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm26992S4R1A3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm26992S4R1A3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm26992S4R1A3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm26992S4R1A3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm26992S4R1A3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm26992S4R1A3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm26992S4R1A3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm26992S4R1A3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm26992S4R1A3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm26992S4R1A3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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