Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms