Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt16Q9Z2K1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.4 ms