Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rlbp1Q9Z275 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms