Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196 ms