Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ccl27Q9Z1X0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ccl27Q9Z1X0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ccl27Q9Z1X0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ccl27Q9Z1X0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ccl27Q9Z1X0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl27Q9Z1X0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms