Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ap3b1Q9Z1T1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms