Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Shcbp1Q9Z179 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms