Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms