Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup160Q9Z0W3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms