Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clip2Q9Z0H8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms