Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cib1Q9Z0F4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms