Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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ChrdQ9Z0E2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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