Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms