Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PplQ9R269 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PplQ9R269 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PplQ9R269 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PplQ9R269 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PplQ9R269 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PplQ9R269 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PplQ9R269 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PplQ9R269 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PplQ9R269 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PplQ9R269 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PplQ9R269 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PplQ9R269 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PplQ9R269 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PplQ9R269 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms