Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms