Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept6Q9R1T4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept6Q9R1T4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept6Q9R1T4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept6Q9R1T4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept6Q9R1T4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept6Q9R1T4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept6Q9R1T4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept6Q9R1T4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept6Q9R1T4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept6Q9R1T4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept6Q9R1T4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept6Q9R1T4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept6Q9R1T4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept6Q9R1T4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept6Q9R1T4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept6Q9R1T4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept6Q9R1T4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept6Q9R1T4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms