Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc26a4Q9R155 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms