Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
NrkQ9R0G8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NrkQ9R0G8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms