Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms