Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp21Q9QZL6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Usp21Q9QZL6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Usp21Q9QZL6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Usp21Q9QZL6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp21Q9QZL6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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