Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms