Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn8Q9QZ49 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms