Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms