Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Rdh11Q9QYF1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Rdh11Q9QYF1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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Rdh11Q9QYF1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Rdh11Q9QYF1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Rdh11Q9QYF1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Rdh11Q9QYF1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Rdh11Q9QYF1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Rdh11Q9QYF1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Rdh11Q9QYF1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Rdh11Q9QYF1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Rdh11Q9QYF1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh11Q9QYF1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms