Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms