Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms